Остановка захваченного поезда довольна проста, так как его дви­жение происходит по опре­деленной дороге. Направление движения поезда может быть пе­ренаправлено в депо (но никогда не на станцию, так как там всегда много гражданских лиц) или на запасной путь, где его ждет заса­да спасательной команды. Очистка поезда от захватчи­ков подобна очистке автобуса, но для каждого вагона необходи­ма полная штурмовая команда.
И в этом случае снайперы могут попытаться уничтожить захват­чиков на расстоянии, но некото­рые высокоскоростные поезда имеют сверхпрочные стекла, ко­торые отражают даже тяжелые снайперские пули. Один из спо­собов, которому обучают спаса­телей — это проделывание от­верстия в крыше поезда с помо­щью кумулятивного заряда, от­верстие служит для входа внутрь вагона.
Оказавшись внутри поезда, штурмовая команда использует такое же построение, что и при освобождении заложников из ав­тобуса. Одна из самых предста­вительных операций по освобож­дению заложников из поезда бы­ла осуществлена голландскими морскими пехотинцами, когда шесть южномолуккских терро­ристов захватили 23 мая 1977 го­да поезд «Депунт» с 94 пассажи­рами (террористы хотели, чтобы Голландия заставила Индонезию предоставить независимость Южным Молуккским островам).
После трех недель осады для от­влечения террористов над поез­дом был организован пролет на низкой высоте самолетов нидер­ландских ВВС. Затем морские пе­хотинцы ворвались в поезд и уби­ли всех террористов (один за­ложник умер).